Em citros, o controle da Xiloporose é baseado em programas de indexação (testes laboratoriais que demonstram a presença ou não de uma virose) e limpeza de material de propagação (para garantir que a muda não seja levada a campo com a doença). Não há tratamento curativo para o viróide, por isso, deve-se sempre utilizar mudas sadias e de viveiros conhecidos.